本團隊最早是隸屬於工業技術研究院化學工業研究所的「污染防治組」(1986年)，2001年整合至環境與安全衛生技術發展中心的「環境科技研究組」；2006年與能源與環境研究所的產業用水與機能水團隊整合，成立「環境科技組」；2007年把空氣與微汙染分析主題納入，改為「水科技與環境分析技術組」；2010年將水研究團隊獨立出來，成立「水科技組」；到了2012年因應組織重整，整合到材料與化工研究所成立「水科技研究組」至今。
從早期的輔導傳統產業進行工業廢水處理，慢慢演進到協助高科技產業製程廢水處理，從廢水處理到廢水的回收再利用，水科技研究組伴隨著台灣產業的演變，一步一腳印的從實驗室研究，模型廠驗證到實廠設計，研究領域持續擴大成長。在政府的研究經費支持下，已經累積了25年以上的水處理經驗，擁有豐富扎實的技術與實廠放大應用實績，目前已有超過100個以上的成功實廠案例。
本團隊提供水處理產業全面性的解決方案，包括技術研發、實驗室級或實廠級模組測試、技術評估、系統設計、試車、人員操作與教育訓練等專業服務。藉由研究開發計畫以及與國內外廠商的合作，我們建立了具有競爭力的水處理核心技術與專利布局，同時也擁有水處理模組與系統的設計能力。從傳統產業到高科技產業，都是我們服務的對象。我們服務過的產業類型涵蓋廣泛，包括有電子業，面板業，石化業，化工業，食品業，紡織業，鋼鐵業等。我們也技術移轉多項水處理與回收技術至水處理產業，藉由提供技術移轉與服務成功落實應用於各類產業。
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