隨著時代的進步，水利規劃分署已經迎來了嶄新的標誌設計。以「川」的意象主題，在這個新標誌中，「制水閘門」象徵著川流不息的水源需要靠人的勤勞管理，不浪費；「書卷」則代表專業的現地調查、規劃和試驗設計，才能製作出「永續藍圖」；「樹苗」則象徵著對水利人才的培養和發展，而「魚」除了做為「餘」的諧音外，也是是對河川、生態環境與生物多樣性的永續發展的承諾。
新的標誌代表著水利規劃分署技發、水源、河海、排水及試驗等五個科，期許水利人要有多元、包容、專業、勤勉與合作的態度善，傳承著過去經驗與智慧，持續為國家社會的發展貢獻自己的力量。
水利規劃分署自成立以來，始終秉持「專業」、「創新」、「永續」的核心價值，為台灣的水利規劃做出了卓越的貢獻。包括規劃前瞻水利政策、引領水利技術研發、規劃和測試重大水利政策、建立知識庫以共享有關水利規劃相關知識，並提高水利規劃從業人員的核心研發能力。就如同貓頭鷹被視為智慧的象徵，代表著睿智、沉著和冷靜，擁有優秀的觀察力和洞察力。未來，我們也將持續引領台灣的水利規劃邁向更創新的時代。
